Voir la source de Variant Omicron du SARS-CoV-2

{{Semi-protection longue}}
{{Avertissement Covid-19}}
[[Fichier:Novel Coronavirus SARS-CoV-2 (50960620707) (cropped).jpg|vignette|Image d'un spécimen de [[SARS-CoV-2]]. Le variant Omicron présente plusieurs mutations sur le [[péplomère]] ([[Péplomère|spicules]] en vert sur l'image).]]

Le '''variant Omicron''' ({{MSAPI|[ɔmikʀɔn]}}<ref>{{CNRTL|omicron}}.</ref>{{,}}<ref>''[[Le Petit Robert]]'' (2022).</ref>) du [[SARS-CoV-2]], aussi appelé '''B.1.1.529''' (synonyme '''BA.1''') selon les [[lignées Pango]], du clade [[Global Initiative on Sharing Avian Influenza Data|GISAID]] '''GR/484A'''<ref name="WHO-tracking">{{Lien web|titre=Suivi des variants du SARS-COV-2 |url=https://www.who.int/fr/activities/tracking-SARS-CoV-2-variants/tracking-SARS-CoV-2-variants |éditeur=[[Organisation Mondiale de la Santé]] |langue=fr}}.</ref>, est un [[variants du SARS-CoV-2|variant]] du [[coronavirus]] responsable de la [[Covid-19]]. Nommé d'après la lettre grecque [[Omicron]], le premier cas de ce variant est détecté le {{date-|9 novembre 2021}} au [[Botswana]]. Le {{date-|26 novembre 2021}}, il est classé comme [[variant préoccupant]] par l'[[Organisation mondiale de la santé]] (OMS)<ref name="who-statement"/>{{,}}<ref name="26novembre2021_www.telegraph.co.uk"/>{{,}}<ref name=":1" />.

Le {{date- |2021-07-01}}, l'OMS publie la [[lignées Pango|lignée Pango]] '''BA.2''' comme étant une sous-lignée de ''Omicron'', définissant alors BA.1 comme ''alias'' de B.1.1.529<!-- ref></ref -->. Le {{date- |2021-12-07}}, l'OMS publie les [[lignées Pango]] '''BA.3''', '''BA.4''' et '''BA.5''' comme étant des sous-lignées de ''Omicron''<!-- ref></ref -->.

Un nombre inhabituel de [[Mutation (génétique)|mutations]], dont plusieurs inédites ou affectant le [[péplomère]] l'ont rendu plus transmissible et actif face au [[système immunitaire]] ou aux [[Vaccins contre la Covid-19|vaccins]]. Plusieurs restrictions d'entrées de voyageurs venant des pays où il a été détecté ont donc été mises en place au niveau international pour limiter sa propagation. Mi-décembre, il s'était cependant propagé, à une vitesse inédite selon l'OMS<ref>{{lien web|url=https://www.lequotidien.com/2021/12/14/le-variant-omicron-se-propage-a-un-rythme-inedit-appel-a-la-mobilisation-de-loms-9e1bf00f4092579bec5627eca13ed653 |titre=Le variant Omicron se propage à un rythme inédit, appel à la mobilisation de l’OMS {{!}} COVID-19 {{!}} Actualités |site=[[Le Quotidien (Saguenay)|Le Quotidien]] - Chicoutimi |date=2021/12/14 }}.</ref> ;  {{Citation|plus vite que n'importe lequel des variants précédents du coronavirus SARS-CoV-2, infectant facilement même ceux qui avaient été vaccinés ou qui avaient déjà eu le COVID-19}}<ref>{{Article |langue=en |prénom1=Diana |nom1=Kwon |titre=Omicron’s molecular structure could help explain its global takeover |périodique=[[Nature (revue)|Nature]] |volume=602 |numéro=7897 |date=2022-02-17 |issn=0028-0836 |issn2=1476-4687 |doi=10.1038/d41586-022-00292-3 |lire en ligne=https://www.nature.com/articles/d41586-022-00292-3 |consulté le=2022-02-28 |pages=373–374}}.</ref>.

Les virologues rappellent que l'apparition de variants en supplantant d'autres est un phénomène classique dans les épidémies ; un variant pouvant avoir une meilleure [[valeur sélective]] pour de nombreuses raisons autres qu'une meilleure transmissibilité, notamment à cause de changements dans les habitudes de son hôte humain<ref>{{lien web|langue=en |prénom1=Amy B. |nom1=Rosenfeld |prénom2=Vincent R. |nom2=Racaniello |titre=Human Behavior During the Pandemic Is More Important Than Any Covid Variant |url=https://www.nytimes.com/2021/06/27/opinion/covid-vaccine-variants.html |site=[[The New York Times|nytimes.com]] |date=27.6.2021 |consulté le=13.1.2022}}.</ref>{{,}}<ref>{{lien web |lang=en |titre=What is the Delta variant and why is it spreading so quickly? |date=2.10.2021 |consulté le=13.1.2022 |site=[[CGTN (chaîne de télévision)|CGTN]]<!-- ou via interwiki d’un des liens de Wikidata Q97238770 ? --> |url=https://newseu.cgtn.com/news/2021-10-02/What-is-the-Delta-variant-and-why-is-it-spreading-so-quickly--13WNcjlLbFK/index.html}}.</ref>. Début 2022, une étude n'a pas trouvé de différence significative entre la charge virale d'Omicron et Delta<ref>{{Bibliographie|Q110551511}}.</ref>. Quelques jours plus tard, une étude danoise non revue par les pairs suggère que la transmissibilité des variants d'Omicron et Delta ne semble pas différente, les personnes non vaccinées étant aussi susceptibles de contracter l'un ou l'autre variant, mais qu'Omicron semble échapper un peu plus à la vaccination que Delta<ref>{{Bibliographie|Q110589971}}.</ref>. Une fois propagé, le variant Omicron reste toujours la majorité de contamination. Ainsi, en janvier 2023, plus de 99,6% de {{unité|70000 séquences}} détectées dans le monde entier étaient celles d'Omicron, selon l'OMS<ref name=fortune022023 />.

== Origine ==
Selon une étude chinoise<ref>{{Article|langue=en |auteurs= Wei Changshuo, Shan Ke-Jia, Wang Weiguang, Zhang Shuya, Huan Qing, Qiana Wenfeng |titre=Evidence for a mouse origin of the SARS-CoV-2 Omicron variant |périodique={{lien|lang=en|trad=Journal of Genetics and Genomics|texte={{lang|en|J Genet Genomics.}}}} |volume=48 |numéro=12 |date=2021-12-24 |pages=S1673-8527(21)00373-8. |doi=10.1016/j.jgg.2021.12.003 |lire en ligne=https://www.ncbi.nlm.nih.gov/labs/pmc/articles/PMC8702434/ |consulté le=8 janvier 2022}}.</ref>, le variant Omicron, atypique avec ses multiples mutations, résulterait d'une double transmission [[Zoonose|zoonotique]] :
# de l'[[Homo sapiens|humain]] vers la [[souris]], mi-2020 (transmission d'un virus [[SARS-CoV-2]] de la [[Variants du SARS-CoV-2|lignée B.1.1]]) ;
# du rongeur vers l'humain, fin 2021, après s'être adapté aux [[Récepteur (biochimie)|récepteurs cellulaires]] de l'animal.

== Classification ==
=== Nomenclature ===
L'Organisation mondiale de la santé réserve une désignation en lettres grecques pour les « variants préoccupants »<ref name="TheEconomist" />{{,}}<ref name=":1" />.

Le {{date-|26 novembre 2021}}, le groupe consultatif technique de l'OMS sur l'évolution du virus du SRAS-CoV-2 a déclaré que la lignée PANGO B.1.1.529 était un variant préoccupant et l'a désigné par la lettre grecque omicron<ref name="who-statement" />{{,}}<ref name="26novembre2021_www.telegraph.co.uk" />{{,}}<ref name=":1" />.

L'OMS a sauté les lettres précédentes nu et xi dans l'[[Alphabet_grec#Lettres_classiques|alphabet grec]] pour éviter toute confusion avec les similitudes du mot anglais « nouveau » et du nom de famille chinois Xi<ref name="26novembre2021_www.telegraph.co.uk" />{{,}}<ref name=":1" />{{,}}<ref name="TheNewYorkTimes" />{{,}}<ref name="NewsNationNow" />.

Le projet GISAID lui a attribué l'identifiant de clade GR/484A<ref name="Gisaid" /> et le projet {{lang|en|Nextstrain}} lui a attribué l'identifiant de clade 21K<ref name="CoVariants1" />.

== Mutations ==
{| class="wikitable mw-collapsible autocollapse" align="right" style="text-align: left;"
 |+ {{nobr|Définition des mutations dans le<br />variant Omicron SARS-CoV-2{{Break}} }}
 ! [[Gène]]
 ! [[Acide aminé]]
 |-
 !rowspan="11"| [[Cadre de lecture ouvert|Cadre de lecture ORF1ab]]
 |   |nsp3 : K38R
|-
 |   |nsp3 : V1069I
|-
 |   |nsp3 : Δ1265
|-
 |   |nsp3 : L1266I
|-
 |   |nsp3 : A1892T
|-
 |   |nsp4 : T492I
|-
 |   |nsp5 : P132H
|-
 |   |nsp6 : Δ105-107
|-
 |   |nsp6 : A189V
|-
 |   |nsp12 : P323L
|-
 |   |nsp14 : I42V
|-
 !rowspan="34"|  [[Protéine Spike]]
  |  | A67V
|-
 |  | Δ69-70
|-
 |  | T95I
|-
 |  | G142D
|-
 |  | Δ143-145
|-
 |  | Δ211
|-
 |  | L212I
|-
 |  | ins214EPE
|-
 |  | G339D
|-
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|-
 |  | S373P
|-
 |  | S375F
|-
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|-
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|-
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|-
 |  | S477N
|-
 |  | T478K
|-
 |  | E484A
|-
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|-
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|-
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|-
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|-
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|-
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|-
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|-
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|-
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|-
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|-
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|-
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|-
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|-
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|-
 |  | N969K
|-
 |  | L981F
 |-
 !rowspan="1"|  [[Protéine enveloppe du Coronavirus|Protéine enveloppe]]
 |  | T9I
 |-
 !rowspan="3"| {{lien|coronavirus membrane protein|texte=Protéine Membrane}}
 |  | D3G
 |-
 |  | Q19E
 |-
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 |-
 !rowspan="4"| {{lien|coronavirus nucleocapsid protein|texte=Protéine Nucleocapside}}
 |  | P13L
 |-
 |  | Δ31-33
 |-
 |  | R203K
 |-
 |  | G204R
 |-
 |- style="text-align:left;" class="sortbottom"
 | colspan="2" | Sources : {{lang|en|EDCD Threat Assessment Brief}}<ref name="ecdc-threat-assessment-brief" /> CoVariants<ref name="CoVariants1" />
|}

Le variant présente une grande quantité de mutations, dont certaines sont préoccupantes<ref name=":2" /> ou non répertoriées dans les autres variants.

Ainsi, {{unité|32|mutations}} affectent le [[péplomère]], principale cible des [[anticorps]] et vaccins<ref>{{article|langue=en |nom=Cookson |prénom=Clive |nom2=Barnes |prénom2=Oliver |date=2021-11-26 |titre=What we know about Omicron variant that has sparked global alarm |périodique={{lang|en|[[Financial Times]]}} |url=https://www.ft.com/content/42c5ff3d-e676-4076-9b9f-7243a00cba5e |consulté le=2021-11-26}}.</ref>{{,}}<ref name="nature-alert" />.

== Chronologie ==
[[Fichier:Map of countries with confirmed SARS-CoV-2 Omicron variant cases.svg|vignette|gauche|redresse=1.6|Carte des pays concernés par des cas de variant Omicron confirmés le {{date-|26 novembre 2021}}<ref>{{Lien web |langue=en-US |titre=Tracking COVID-19 variant Omicron |url=https://bnonews.com/index.php/2021/11/omicron-tracker/ |site={{lien|lang=en|trad=BNO News}} |date=2021-11-26 |consulté le=2021-11-30}}.</ref>.]]

Le premier spécimen du variant Omicron est recueilli le {{date-|9 novembre 2021}} au [[Botswana]]<ref name="nature-alert">{{article|nom=Callaway |prénom=Ewen |date=2021-11-25 |titre=Heavily mutated coronavirus variant puts scientists on alert |url=https://www.nature.com/articles/d41586-021-03552-w |journal=[[Nature (revue)|Nature]] |langue=en |doi=10.1038/d41586-021-03552-w}}.</ref>. Il est également détecté en [[Afrique du Sud]]<ref>{{lien web|titre=outbreak.info <!-- ne serait-il pas préférable de préciser « s:S371L Mutation Report », voire détailler plus encore ? --> |url=https://outbreak.info/situation-reports?pango&muts=s%3AS371L&loc=ZAF&loc=BWA&overlay=false |consulté le=2021-11-26 |website=outbreak.info |langue=en}}.</ref> et à [[Hong Kong]] chez un voyageur de retour d'Afrique du Sud<ref>{{lien web |lang=en |url=https://www.bbc.co.uk/news/health-59418127 |titre=Covid: New heavily mutated variant B.1.1.529 in South Africa raises concern |date=25 novembre 2021 |site={{lang|en|[[BBC News]]}} |consulté le=25 novembre 2021}}.</ref>{{,}}<ref name="WHO21Nov">{{lien web|url=https://www.who.int/fr/activities/tracking-SARS-CoV-2-variants/tracking-SARS-CoV-2-variants/ |titre=Suivi des variants du SARS-CoV-2 |description={{lang|en|(Tables: Currently designated Variants Under Monitoring -describes 529 variant as present in 'Multiple countries'- and 'Formerly monitored variants'- B.1.523 & B.1.619 Reclassified Nov 2021)}} |site=[[Organisation mondiale de la santé|who.int]] |consulté le=25 novembre 2021}}.</ref>. Un autre cas est identifié en [[Israël]] chez un voyageur de retour du [[Malawi]]<ref name="tweet0016">{{Citation tweet |language=en <!-- |author=  voir note ci-après --> |user=BNODesk <!-- selon le lien https://twitter.com/medriva/status/1464132888673280016 l’utilisateur Twitter se nomme « BNO|Medriva Newsroom » avec « @medriva » en lieu et place de « BNODesk » faut-il modifier les paramètres renseignés ? --> |number=1464132888673280016 |title=Statement from Israel's health ministry reporting 1 confirmed case of new coronavirus variant B.1.1.529 [unofficial translation] |date=26 novembre 2021 |access-date=26 novembre 2021}}.</ref>. Un cas est également détecté en [[Belgique]] chez un voyageur qui l'aurait éventuellement attrapé en [[Égypte]] avant le {{date-|11 novembre}}<ref>{{article|nom=Reuters |date=2021-11-26 |titre=Belgium detects first case of new COVID-19 variant in Europe |langue=en |périodique=[[Reuters]] |url=https://www.reuters.com/business/healthcare-pharmaceuticals/belgium-detects-first-case-new-covid-19-variant-europe-2021-11-26/ |consulté le=2021-11-26}}.</ref>.

Les quatre premiers cas rapportés au Botswana, ainsi que les trois confirmés et suspectés en Israël, proviennent de personnes entièrement vaccinées<ref>{{Lien web |langue=en |titre=Four cases of the new COVID-19 variant recorded in Botswana |url=https://www.mmegi.bw/news/four-cases-of-the-new-covid-19-variant-recorded-in-botswana/news |date=25 novembre 2021 |site=[[Mmegi|{{lang|en|Mmegi Online}}]] |consulté le= 26 novembre 2021}}.</ref>{{,}}<ref name="tweet0016" />.

Fin {{date-|novembre 2021}}, plusieurs États ont pris des mesures envers les voyageurs provenant de pays d'[[Afrique australe]] où le variant a été détecté. Certains interdisent les vols en provenance de ces pays, alors que d'autres demandent aux voyageurs de respecter un certain temps de [[quarantaine]]<ref>{{lien web|langue=en |nom1=Linskey |prénom1=Annie |titre=U.S. to restrict travel from South Africa and other countries as it assesses risks of new omicron variant |url=https://www.washingtonpost.com/politics/2021/11/26/biden-south-africa-variant/ |website=[[The Washington Post|{{lang|en|Washington Post}}]] |consulté le=26 novembre 2021 |date=26 novembre 2021}}.</ref>{{,}}<ref>{{article|nom=Walsh |prénom=Marieke |nom2=Stone |prénom2=Laura |date=2021-11-26 |titre=COVID-19 variant of concern Omicron causes Canada to impose restrictions on travel from southern parts of Africa |langue=en-CA |périodique={{lang|en|[[The Globe and Mail]]}} |url=https://www.theglobeandmail.com/politics/article-premiers-federal-conservatives-call-for-increased-travel-restrictions/ |consulté le=2021-11-26}}.</ref>.

Des inquiétudes à propos du possible impact économique du variant entraînent, en {{date-|novembre 2021}}, une chute globale des [[Bourse des valeurs|marchés boursiers]], dont le plus important recul de l'année pour le {{lang|en|[[Dow Jones Industrial Average]]}}. Le prix des pétroles de type {{lang|en|[[Brent Crude]]}} et {{lang|en|[[West Texas Intermediate]]}} chute respectivement de 10 % et 11,7 %<ref>{{lien web|langue=en |nom1=Gregg |prénom1=Aaron |titre=Dow plunges more than 900 points as new coronavirus variant sends global markets reeling |url=https://www.washingtonpost.com/business/2021/11/26/stock-market-black-friday/ |website=[[The Washington Post|{{lang|en|Washington Post}}]] |consulté le=26 novembre 2021 |date=26 novembre 2021}}.</ref>.

== Épidémiologie ==
Une augmentation exponentielle du nombre de cas [[Pandémie de Covid-19 en Afrique du Sud|partout en Afrique du Sud]], constatée à partir du {{date-|19 novembre 2021}}, et principalement dans le [[Gauteng]], serait attribuable à la lignée B.1.1.529<ref>{{ lien web | url=https://www.lequotidien.com/2021/11/26/quest-ce-que-ce-nouveau-variant-en-afrique-du-sud-ee94620598c58563619447a23d23ed27 | titre=Qu’est-ce que ce nouveau variant en Afrique du Sud ? |site=[[Le Quotidien (Saguenay)|lequotidien.com]] |date=26 novembre 2021}}.</ref>{{,}}<ref name=":2">{{article|langue=en |url=https://www.euronews.com/next/2021/11/25/what-we-know-so-far-about-the-b-1-1-529-covid-variant-causing-concern-in-south-africa |titre=What we know so far about the B.1.1.529 'Omicron' COVID variant causing concern |périodique=[[Euronews]] |prénom1=Luke |nom1=Hurst |prénom2=Tom |nom2=Bateman |auteur institutionnel=avec [[Agence France-Presse|AFP]] |date=25 novembre 2021 <!--cf. « dateCreated » dans le code source ; note : modifié le 2021-11-30 --> |consulté le=26 novembre 2021}}.</ref>{{,}}<ref>{{lien web |titre=Patients Omicron : des « symptômes légers », selon un médecin sud-africain |url=https://ici.radio-canada.ca/nouvelle/1843338/patients-omicron-symptomes-legers-medecin-sud-africain |site=[[ICI Radio-Canada Première|ici.radio-canada.ca]] |date=28-11-2021 |consulté le=05-12-2021}}.</ref>.

Le {{date-|27 novembre 2021}}, le variant est également détecté dans quelques pays d'[[Europe]] : [[Royaume-Uni]], [[Allemagne]], [[Italie]], [[Belgique]], [[Tchéquie]]<ref>{{lien web |auteur institutionnel=CNEWS |titre=DIRECT - Coronavirus : le variant Omicron est arrivé en Europe |url=https://www.cnews.fr/monde/2021-11-27/direct-coronavirus-plusieurs-pays-deurope-detectent-pour-la-premiere-fois-le |site=[[CNews|cnews.fr]] |date=27-11-2021 |consulté le=28-11-2021}}.</ref>.

Le même jour, l'[[Institut national des maladies transmissibles]] de l'[[Afrique du Sud]] publie que {{unité|30904|[[Test diagnostique du SARS-CoV-2|tests COVID]]}} effectués ont révélé {{unité|2828|nouvelles}} infections (un quota de 9,2 %) pour un seul jour<ref>{{lien web|lang=en |site=[[Institut national des maladies transmissibles|nicd.ac.za]] |url=https://www.nicd.ac.za/latest-confirmed-cases-of-covid-19-in-south-africa-26-november-2021/ |titre=LATEST CONFIRMED CASES OF COVID-19 IN SOUTH AFRICA ({{nobr|26 November 2021}}) |date=26 novembre 2021}}.</ref>. Une semaine plus tard, {{unité|65990|tests}} révèlent {{unité|16055|nouvelles}} infections (un quota de 24,3 % et une croissance de 470 %)<ref>{{lien web|lang=en |site=[[Institut national des maladies transmissibles|nicd.ac.za]] |url=https://www.nicd.ac.za/latest-confirmed-cases-of-covid-19-in-south-africa-3-december-2021/ |titre=LATEST CONFIRMED CASES OF COVID-19 IN SOUTH AFRICA ({{nobr|3 December 2021}}) |date=3 décembre 2021}}.</ref>{{,}}<ref>{{lien web|lang=en |site=[[Institut national des maladies transmissibles|nicd.ac.za]] |url=https://gis.nicd.ac.za/portal/apps/opsdashboard/index.html#/15eb33988f104b73867606c1248578ff |titre=GIS dashboard |description=(données statistiques)}}.</ref>.

Mi-{{date-|décembre 2021}}, le variant Omicron est à l'origine de 40 % des cas de contamination à Londres<ref>{{lien web|url=https://www.latribune.fr/depeches/reuters/KBN2IS117/coronavirus-omicron-a-l-origine-d-environ-40-des-infections-a-londres.html |titre=Coronavirus : Omicron à l'origine d'environ 40 % des infections à Londres |site=[[La Tribune (France, 1985)|La Tribune]] |auteur institutionnel=[[Reuters]] |date=13/12/2021}}.</ref>, ce qui est qualifié de {{citation|raz-de-marée}} par [[Boris Johnson]]<ref>{{lien web|url=https://www.ouest-france.fr/sante/virus/coronavirus/face-au-raz-de-maree-omicron-le-royaume-uni-mise-sur-la-troisieme-dose-de-vaccin-d3b1851c-5b8a-11ec-98cc-6a7d5282ee91 |titre=Face au « raz-de-marée Omicron », le Royaume-Uni mise sur la troisième dose de vaccin |site=[[Ouest-France]] |date=12/12/2021}}.</ref>.

À la date du {{date|4|décembre|2021}}, le variant Omicron ne représente que 0,7 % des cas de Covid-19 aux [[États-Unis]] et le variant Delta 99,3 %. À peine deux semaines plus tard, le {{date-|18 décembre}}, il compte pour 73,2 % des cas, le variant Delta ne représentant plus que 26,6 %<ref>{{Lien web |langue=en |titre=Monitoring Variant Proportions |url=https://covid.cdc.gov/covid-data-tracker/#variant-proportions |site={{lang|en|[[Centres pour le contrôle et la prévention des maladies|CDC]] COVID Data Tracker}} |date=18 décembre 2021 |consulté le=20 décembre 2021}}.</ref>. Selon une étude préliminaire de l'université de [[Hong Kong]], le variant Omicron se répliquerait {{nombre|70|fois}} plus vite dans les bronches mais {{nombre|10|fois}} moins dans les poumons que le virus originel. Ce résultat indiquerait un virus nettement plus contagieux mais potentiellement moins dangereux : en fait, ce résultat ne dit pas grand chose autre que le taux de réplication du virus mesuré dans les bronches ou poumons<ref>{{Article|langue=en |titre=HKUMed finds Omicron SARS-CoV-2 can infect faster and better than Delta in human bronchus but with less severe infection in lung | périodique={{lien|lang=en|trad=Li Ka Shing Faculty of Medicine|texte={{lang|en|LKS Faculty of Medicine News}}}}, ([[Université de Hong Kong]]) | date=15 décembre 2021 |lire en ligne=https://www.med.hku.hk/en/news/press/20211215-omicron-sars-cov-2-infection |consulté le=24 décembre 2021}}.</ref>.

Le {{date|20 décembre 2021}}, un communiqué officiel informe du premier mort aux [[Pandémie de Covid-19 aux États-Unis|États-Unis]], au [[Texas]], en relation avec le variant Omicron. Il s'agit d'un homme de la cinquantaine, non vacciné et qui avait déjà été affecté par la Covid-19<ref>{{Article|langue=en |auteur1=Maroosha Muzaffar |titre=Unvaccinated Texas man first in US to die of Omicron variant |périodique={{lang|en|[[The Independent]]}} |date=21 décembre 2021 |lire en ligne=https://www.independent.co.uk/news/world/americas/us-covid-omicron-death-texas-b1979890.html}}.</ref>.

== Caractéristiques ==
Selon l'OMS, le risque de contracter une forme grave est moins important qu'avec les autres formes du Covid-19, mais sa propagation est plus rapide<ref>{{Lien web |titre=Omicron : l'OMS assure que ce nouveau variant ne provoque pour l'heure que des formes "légères" du Covid-19 |url=https://www.ladepeche.fr/2021/12/01/variant-omicron-toux-fatigue-loms-rend-ses-conclusions-sur-les-symptomes-provoques-par-cette-nouvelle-souche-9963879.php |site=[[La Dépêche du Midi]] |date=1 décembre 2021}}.</ref>. Une étude de {{date-|décembre 2021}} sur des pseudovirus estime qu'il est quatre fois plus infectieux (et non pas contagieux) que le [[type naturel]] et deux fois plus que le [[Variants Kappa et Delta du SARS-CoV-2|variant Delta]]<ref>{{Article|langue=en |auteur1=Wilfredo F Garcia-Beltran |et al.=oui |titre=mRNA-based COVID-19 vaccine boosters induce neutralizing immunity against SARS-CoV-2 Omicron variant |périodique=[[medRxiv]] |date=14 décembre 2021 |lire en ligne=https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2021.12.14.21267755v1}}.</ref>.

Les études initiales en Afrique du Sud publiées en {{date-|décembre 2021}}, sur un nombre réduit de patients, mettent en évidence que l'échappement immunitaire est plus important que celui observé pour les précédents variants. L'action des anticorps produits par les personnes vaccinées (après deux doses du vaccin de Pfizer<ref>{{Lien web |langue=fr |titre=Décembre à la maison, Noël Omicron |url=https://lesjours.fr/obsessions/covid-cinquieme-vague/ep2-manuel-survie-apocalypse-covid-15-decembre/ |site=[[Les Jours]] |date=2021-12-15 |consulté le=2021-12-16}}.</ref>) est quarante fois moins bonne contre le variant omicron que contre la souche historique. Selon les premières études européennes, le même schéma vaccinal entraînerait une perte d'efficacité totale ou seulement sept fois inférieure. Toutefois, une troisième dose de vaccin rétablirait une protection partielle. Christian Drosten, directeur du département de virologie de l’hôpital universitaire berlinois de la Charité, nuance ces premiers résultats, en soulignant qu'{{citation|une réduction de {{nombre|40|fois}} l’activité de neutralisation ne signifie pas que la vaccination protégera {{nombre|40|fois}} moins. La perte réelle de l’immunité est bien moindre}} et la protection contre les formes graves pourrait être conservée<ref>{{Lien web|titre=Le variant omicron contourne davantage nos défenses mais sa gravité reste en question |url=https://www.liberation.fr/societe/sante/le-variant-omicron-contourne-davantage-nos-defenses-mais-sa-gravite-reste-en-question-20211209_IVCLA3TJ2ZBT7FQYQVR3Q4AOAU/ |site=[[Libération (journal)|Libération]] |date=9 décembre 2021}}.</ref>.

Une étude [[Prépublication (édition scientifique)|prépubliée]] en {{date-|décembre 2021}} menée sur neuf [[Anticorps monoclonal|anticorps monoclonaux]] utilisés en clinique ou en phase de développement préclinique montre que six d'entre eux sont totalement inefficaces face au variant Omicron, tandis que les trois autres voient leur efficacité diminuée de {{nombre|3|à=80|fois}} par rapport à leur action sur le variant Delta. Les tests menés sur des sujets un mois après une troisième dose du [[Tozinaméran|vaccin Pfizer]] montrent son efficacité contre le variant Omicron, mais également que ce variant nécessite une quantité d'anticorps de {{nombre|5|à=31|fois}} supérieure à celle nécessaire pour le variant Delta pour être neutralisé. La durée de cette efficacité n'est toujours pas connue. La même étude montre par contre que des patients ayant été symptomatiques il y a plus de {{nombre|12|mois}} ou ayant reçu les deux doses du vaccin Pfizer il y a plus de cinq mois ne sont quasiment pas protégés contre le variant Omicron<ref name="pasteur20211220">{{Lien web |langue=fr |titre=Covid-19 - Omicron : résistant à la plupart des anticorps monoclonaux mais neutralisé par la {{3e|dose}} |url=https://www.pasteur.fr/fr/espace-presse/documents-presse/covid-19-omicron-resistant-plupart-anticorps-monoclonaux-neutralise-3e-dose |site=[[Institut Pasteur]] |date=20 décembre 2021 |consulté le=20 décembre 2021}}.</ref>{{,}}<ref>{{Article|langue=en |auteur1=Delphine Planas |auteur2=Nell Saunders |auteur3=Piet Maes |et al.=oui |titre=Considerable escape of SARS-CoV-2 variant Omicron to antibody neutralization |périodique=[[BioRxiv]] |date=15 décembre 2021 |lire en ligne=https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2021.12.14.472630v1}}.</ref>.

Une [[Prépublication (édition scientifique)|prépublication]] de l'[[Imperial College London|{{lang|en|Imperial College}}]] parue le {{date|22|décembre|2021}} suggère un plus faible risque d'hospitalisation avec le variant Omicron qu'avec le variant Delta, en notant toutefois une population plus jeune touchée par le variant Omicron donc moins à risque<ref>{{Article |langue=en |auteur1=Neil Ferguson |auteur2=Azra Ghani |auteur3=Wes Hinsley |auteur4=Erik Volz |titre=Report 50: Hospitalisation risk for Omicron cases in England |périodique=[[Imperial College London|{{lang|en|Imperial College}}]] |date=22 décembre 2021 |lire en ligne=https://www.imperial.ac.uk/media/imperial-college/medicine/mrc-gida/2021-12-22-COVID19-Report-50.pdf}}.</ref>.

En ce qui concerne le syndrome dit [[Covid long]], une étude publiée dans le ''[[British Medical Journal]]'' en juin 2022 présente que l'apparition de syndrome est moins fréquente que celle du [[Variants Kappa et Delta du SARS-CoV-2|variant Delta]]. La conclusion a été donnée, en comparaison entre {{unité|56003 adultes}} testés positifs avec le variant Omicron du 20 décembre 2021 au 9 mars 2022 et {{unité|41361 adultes}} contaminés par le Delta ainsi que testés du {{1er}} juin au 27 novembre 2021. Le syndrome Covid long était déclaré par {{unité|2501 patients}} ayant contaminé l'Omicron, soit 4,5%. Parmi les patients de Delta, {{unité|4469 adultes}}, soit 10,8%, subissaient ce syndrome<ref>{{Article|langue=en|lire en ligne=https://www.bmj.com/content/377/bmj.o1500|titre=Covid-19 : Long covid risk is lower with omicron than delta, researchers find|périodique=British Medical Journal|année=2021|mois=6|jour=17|auteur1=Jacqui Wise|tome=377}}</ref>.

Certes, en comparaison avec le variant Delta, la tendance est que le symptôme de variant Omicron est moins grave. D'où, en Suisse, des voix s'élevaient pour classifier et traiter le Covid Omicron comme grippe normale. Or, le 15 février 2023, une équipe de l'[[université de Lucerne]] révélait que la mortalité des personnes hospitalisées à cause du variant Omicron (95% en B.1.1.529) reste 54% supérieure à celle des patients de grippe. La mortalité à cause d'Omicron augmente aussi deux ou trois fois élevée, parmi ceux qui avaient été accueillies par l'[[unité de soins intensifs|admission aux soins intensifs (USI)]], notamment pour les personnes âgées et celles qui subissaient la démence<ref>{{article|langue=fr|année=2023|mois=2|jour=16|auteur1=|titre=Covid : Omicron est plus mortel que la grippe|périodique=Le Nouvelliste|lire en ligne=https://www.lenouvelliste.ch/suisse/covid-omicron-est-plus-mortel-que-la-grippe-1264030}}</ref>. L'analyse, à la base des renseignements auprès de quinze hôpitaux en Suisse, suggère que le virus Omicron doit être traité encore sérieux, en raison de sa mortalité élevée lors de l'hospitalisation<ref>{{article|langue=en|titre=Adults hospitalized with Omicron die at 1.5 times rate than those admitted with flu : study|année=2023|mois=2|jour=17|auteur1=Frank Diamond|lire en ligne=https://www.fiercehealthcare.com/providers/adults-hospitalized-omicron-die-15-times-rate-those-admitted-flu-study|périodique=Fierce Helthcare}}</ref>{{,}}<ref>{{article|langue=en|périodique=University of Minnesota, CIDRAP|titre=Omicron hospital illness 54% deadliner than flu hospital cases, study finds|année=2023|mois=2|jour=17|auteur1=Mary Van Beusekom|lire en ligne=https://www.cidrap.umn.edu/covid-19/omicron-hospital-illness-54-deadlier-flu-hospital-cases-study-finds}}</ref>.

== Capacité supérieure du variant Omicron ==
La structure moléculaire d'Omicron, comparée avec celle du SRAS-CoV-2 originel et de ses autres variantes, montre des caractéristiques lui permettant d'échapper à nos défenses immunitaires, tout en maintenant sa capacité infectieuse, mais avec une maladie plus bénigne que pour les variants précédents, peut être parce qu'il semble moins adapté aux poumons qu'à la zone nez-gorge<ref name="Nat2022" />. Plus de 30 des mutations concernent la [[protéine de pointe]] qui permet au virus de s'ancrer sur ses cellules hôtes, alors que les variants précédents ne présentaient chacun qu'une dizaine de mutations sur leurs protéines de pointe. Et 15 de ces mutations concernent le domaine de liaison au récepteur de la protéine (RBD), qui permet la liaison avec la protéine [[Enzyme de conversion de l'angiotensine 2|ACE2]] de l'hôte<ref name="Nat2022" />. Ce nombre de mutations est plus élevé que pour les variants précédents (les variants Delta et Alpha, antérieurs) ; chez les personnes guéries d'une Covid et/ou vaccinées, ces mutations ont remodelé les zones de la protéine reconnues par des anticorps « neutralisants », permettant de nouvelles infections<ref name="Nat2022" />. L'effet net est qu'Omicron se lie à [[Enzyme de conversion de l'angiotensine 2|ACE2]] plus fortement que la version originale du SRAS-CoV-2, et aussi fortement que le variant Delta. Par [[sélection naturelle]], Omicron a adopté une {{Citation|solution moléculaire très élégante, où les mutations médient l'[[évasion immunitaire]]<!-- si possible proposer un lien interwiki --> tout en améliorant la liaison aux récepteurs}}<ref>{{Article |langue=en |prénom1=Matthew |nom1=McCallum |prénom2=Nadine |nom2=Czudnochowski |prénom3=Laura E. |nom3=Rosen |prénom4=Samantha K. |nom4=Zepeda |titre=Structural basis of SARS-CoV-2 Omicron immune evasion and receptor engagement |périodique=[[Science (revue)|Science]] |volume=375 |numéro=6583 |date=2022-02-25 |issn=0036-8075 |issn2=1095-9203 |doi=10.1126/science.abn8652 |lire en ligne=https://www.science.org/doi/10.1126/science.abn8652 |consulté le=2022-02-28 |pages=864–868}}.</ref> (ses interactions entre le RBD d'Omicron et l'[[Enzyme de conversion de l'angiotensine 2|ACE2]] sont améliorées par rapport aux variants précédents)<ref name="Nat2022">{{Article |langue=en |prénom1=Thomas P. |nom1=Peacock |prénom2=Jonathan C. |nom2=Brown |prénom3=Jie |nom3=Zhou |prénom4=Nazia |nom4=Thakur |et al.=oui |titre=The SARS-CoV-2 variant, Omicron, shows rapid replication in human primary nasal epithelial cultures and efficiently uses the endosomal route of entry |périodique=[[bioRxiv]] |éditeur={{lang|en|Microbiology}}<!-- est-ce qu’on peut ajouter le lien interwiki  {{lien|lang=en|trad=Microbiology (journal)|texte={{lang|en|Microbiology}}}} ou ce lien ne correspond pas au même éditeur ? --> |date=2022-01-03 |doi=10.1101/2021.12.31.474653 |lire en ligne=http://biorxiv.org/lookup/doi/10.1101/2021.12.31.474653 |consulté le=2022-02-28}}.</ref>. Omicron utilise une voie de pénétration de la cellule plus lente, via des bulles ([[endosome]]s)<ref name="Nat2022" />.

À la différence d'autres souches du Covid-19, le variant Omicron garde, depuis son apparition, une longue et large domination. Les chercheurs expliquent ces raisons par, d'une part, sa forte transmissibilité et, d'autre part, sa capacité d'échappement immunitaire. Ainsi, le sous-lignage BA.2.75.2<ref name="ba2752">Le Monde, ''BA.2.75.2, le nouveau sous-variant d'Omicron qui inquiète les scientifiques'', le 19 septembre 2022 [https://www.lemonde.fr/blog/realitesbiomedicales/2022/09/19/ba-2-75-2-le-nouveau-sous-variant-domicron-qui-inquiete-les-scientifiques/]</ref>, qui avait été récemment identifié, a échappé à douze des treize anticorps, dans le laboratoire de l'[[institut Karolinska]]. Benjamin Davido, infectiologue de l'[[hôpital Raymond-Poincaré]], résume que le variant Omicron est celui qui sait se réinventer pour rester<ref>20 minutes, ''Covid-19 : Comment expliquer la suprématie d'Omicron, toujours pas supplanté par un variant ?'', le 29 septembre 2022 [https://www.20minutes.fr/sante/4002846-20220929-covid-19-comment-expliquer-suprematie-omicron-toujours-supplante-nouvea-variant]</ref>. En février 2023, le docteur Sara Cody, directrice de la sante publique de [[Santa Clara (Californie)|Santa Clara]], souligne : « Ce que nous avons appris sur ce virus est qu'il continue à se changer et à se modifier, et qu'il s'agit d'une sorte de danse entre l'immunité de la population et ce que le virus fait. C'est un changement sans arrêt. C'est dynamique<ref name=lax />. »

== Efficacité des vaccins avec le variant Omicron ==
Une étude publiée en {{date-|décembre 2021}} ayant testé l'efficacité de six vaccins face au variant Omicron observe que seuls trois patients sur 13 ayant reçu deux doses du [[BBIBP-CorV]] de [[Sinopharm]], un patient sur 12 ayant reçu le [[Ad26.COV2.S|vaccin Janssen]] et aucun des {{nombre|11|patients}} complètement vaccinés avec le [[Spoutnik V]] généraient des anticorps neutralisants contre le variant Omicron. Les trois autres vaccins testés, d'[[Vaccin d'AstraZeneca-Oxford contre la Covid-19|AstraZeneca]], [[mRNA-1273|Moderna]] et [[Tozinaméran|Pfizer–BioNTech]], étaient également moins efficaces avec seulement deux doses<ref>{{Article |langue=en |titre=Sinopharm, Johnson & Johnson, Sputnik vaccines weaker against omicron – study |périodique={{lang|en|{{lien|lang=en|trad=Gulf Business}}}} |date=19 décembre 2021 |lire en ligne=https://gulfbusiness.com/sinopharm-johnson-johnson-sputnik-vaccines-weaker-against-omicron-study/}}.</ref>.

Le {{date|8 décembre 2021}}, le [[Conseil scientifique Covid-19|Conseil scientifique]] émet un avis annonçant : {{citation|La dose de rappel de Moderna est actuellement de {{unité|50|µg}}. Elle pourrait être augmentée dans les semaines qui viennent à {{unité|100|µg}} pour induire une meilleure réponse immunologique vis-à-vis du variant Omicron}}<ref>{{lien web|auteur= Salomé Vincendon |url=https://www.bfmtv.com/sante/variant-omicron-le-conseil-scientifique-recommande-d-augmenter-la-dose-de-rappel-de-moderna_AN-202112140279.html |titre=Variant Omicron : le Conseil scientifique recommande d’augmenter la dose de rappel de Moderna |site=[[BFM TV]] |date=14/12/2021}}.</ref>. Un communiqué de presse de Moderna du {{date-|20 décembre}} affirme que la dose de {{nombre|50|µg}} augmente le niveau des anticorps neutralisants contre le variant Omicron d'un {{nobr|facteur 37}}, celle à {{nombre|100|µg}} d'un {{nobr|facteur 83}}<ref>{{Lien web |langue=en |titre=Moderna Announces Preliminary Booster Data and Updates Strategy to Address Omicron Variant |url=https://investors.modernatx.com/news/news-details/2021/Moderna-Announces-Preliminary-Booster-Data-and-Updates-Strategy-to-Address-Omicron-Variant/default.aspx |site=[[Moderna|investors.modernatx.com]] |date=20 décembre 2021 |consulté le=20 décembre 2021}}.</ref>. Mais cette approche n'a pas abouti, Moderna et Pfizer préférant développer des vaccins bivalents, protégeant à la fois contre la souche historique et une souche Omicron. Ils sont déployés à l'automne 2022.

== Sous-variants d'Omicron ==
=== BA.1, BA.2, BA.3, BA.4 et BA.5 ===
Les virus mutent et produisent différentes lignées. Ainsi, au côté du variant Omicron BA.1, sont apparus les variants BA.2 et BA.3 qui lui sont apparentés. Ces trois variants partagent vingt-et-une mêmes mutations dans leur protéine spiculaire mais huit autres mutations sont spécifiques à BA.2 et six à BA.1. Celui-ci partage par ailleurs dix autres mutations avec BA.3. Enfin BA.2 et BA.3 partagent deux autres mutations<ref name="MG222">{{lien web|auteur=Marc Gozlan |url=https://www.lemonde.fr/blog/realitesbiomedicales/2022/02/18/dans-le-sillage-domicron-les-singularites-de-ba-2/ |titre=Dans le sillage d’Omicron, les singularités de BA.2 |date=18/02/2022 |site=[[Le Monde]] }}.</ref>.

En {{date-|janvier 2022}} au [[Danemark]], le sous-variant BA.2 a déjà remplacé BA.1, un phénomène également constaté au Royaume-Uni, aux [[États-Unis]] et en [[Norvège]], selon l'{{lien|lang=da|trad=Statens Serum Institut|texte=Institut {{lang|da|Statens Serum}}}} à [[Copenhague]]<ref>{{lien web|lang=en |site={{lang|da|{{lien|lang=da|trad=Statens Serum Institut}}}} (Danemark) |date=20 janvier 2022 |url=https://en.ssi.dk/news/news/2022/omicron-variant-ba2-accounts-for-almost-half-of-all-danish-omicron-cases |titre=Now, an Omicron variant, BA.2, accounts for almost half of all Danish Omicron-cases }}.</ref>. Ce dernier confirma encore, le {{date-|31 janvier}}, que le variant BA.2 est plus transmissible que le BA.1, à la suite des études effectuées au Danemark. En ce qui concerne les Danois vaccinés, la transmission de BA.2 demeure moins agressive qu'auprès de ceux qui ne sont pas vaccinés<ref>{{lien web|lang=en |site={{lang|da|{{lien|lang=da|trad=Statens Serum Institut}}}} |date=31 janvier 2022 |url=https://en.ssi.dk/news/news/2022/ba2-more-transmissible-than-ba1-vaccinated-less-likely-to-infected-pass-on-infection |titre=BA.2 is more transmissible than BA.1 but vaccinated persons are less likely to be infected and to pass on infection }}.</ref>.

Comme les autres variants, le variant Omicron (BA.1), au cours de sa propagation, finit par muter et produire à son tour des sous-variants comme BA.1.1 qui se distingue de BA.1 par la mutation R346K<ref name="MG222" />.

Le [[SARS-CoV-2|virus de la Covid-19]] évolue sans arrêt. Un nouveau variant Omicron BA.2.12.1, qui avait été détecté à New York en {{date-|février 2022}}, devint rapidement majoritaire dans cette ville et alentour. Ce sous-variant conserve les deux mutations S704L et L452Q héritées du BA.2 classique. Il a été supplanté par le BA.5 à l'été 2022<ref>https://www.ouest-france.fr/sante/virus/coronavirus/covid-19-ce-que-l-on-sait-du-sous-variant-ba-2-75-surnomme-centaure-qui-est-apparu-en-inde-ce072ea6-041c-11ed-96d1-e951efc4fb01</ref>.

Les variants BA.4 et BA.5, détectés en Afrique, ont acquis la mutation [[L452R]] qui contribuait à la propagation du variant Delta<ref>{{lien web|lang=en |site={{lang|en|[[Cable News Network]]}} |auteur=Brenda Goodman |titre=New versions of Omicron variant make gains against BA.2 |date=19 avril 2022 |url=https://edition.cnn.com/2022/04/19/health/ba-2-12-1-takes-on-ba-2/index.html}}.</ref>. Par ailleurs, le variant BA.4 est une recombinaison de BA.1 et de BA.3<ref>{{Article |auteur1= |titre=Covid - Omicron : avantage de croissance, contagiosité, sévérité, pourquoi l'OMS surveille attentivement les nouveaux variants BA.4 et BA.5 ? |périodique=[[L'Indépendant (Pyrénées-Orientales)|L'Independant]] |date=12 avril 2022 |pages= |lire en ligne= https://www.lindependant.fr/2022/04/12/covid-omicron-avantage-de-croissance-contagiosite-severite-pourquoi-loms-surveille-attentivement-les-nouveaux-variants-ba4-et-ba5-10231044.php }}.</ref>.

En juillet 2022, les spécialistes étaient attentifs à deux nouveaux variants : BA.5.3.1 et BA.2.75, dit ''Centaurus'' (Centaure), détecté pour la première fois en Inde puis en Australie, au Japon, au Canada, aux États-Unis, en Allemagne, au Royaume-Uni et aux Pays-Bas. Ce dernier présente de {{nb|8 nouvelles}} mutations par rapport à la souche de BA.2, dont la mutation G446S affectant une zone ''a priori'' « très antigénique » (le domaine de liaison au récepteur) et qui pourrait permettre d'échapper aux anticorps neutralisants ou d'affecter sa sévérité<ref>{{Lien web|url=https://www.ladepeche.fr/2022/07/07/variant-ba275-du-covid-19-mutations-nouvelles-plus-grande-contagiosite-ce-que-lon-sait-du-virus-deja-detecte-en-europe-10421662.php|titre=Variant "Centaure" BA.2.75 d'Omicron : mutations, contagiosité... ce que l'on sait du virus déjà détecté en Europe|site=[[La Dépêche du Midi|La Dépêche]]|en ligne le=14/07/2022}}.</ref>{{,}}<ref>{{Lien web|url=https://www.20minutes.fr/sante/3325451-20220713-covid-19-nouveau-sous-variant-ba275-surnomme-centaure-detecte-pays-bas|titre=Covid-19 : Le nouveau sous-variant BA.2.75, surnommé le « centaure », détecté aux Pays-Bas|site=20 Minutes|en ligne le=13/07/22}}.</ref>. C'est la raison pour laquelle le BA.2.75 était particulièrement surveillé par les chercheurs aux États-Unis. Quant au BA.5.3.1, lui aussi possède une mutation inédite, N:E136D. En Allemagne, ce sous-variant représenterait 80 % des cas de BA.5<ref name="fortune">''Fortune'', ''New Omicron spawn like Centaurus and Bad Ned may be the reason you have a weird summer cold (or worse)'', le 9 juillet 2022 {{en}}[https://fortune.com/2022/07/09/centaurus-bad-ned-omicron-covid-ba-2-75-ba-5-3-1-ba275-ba531-variants-subvariants-centaurus-in-us-bad-ned-in-us/]</ref>.

Selon Daniel Robert Kuritzkes ([[Harvard Medical School]]), le Covid-19 n'évolue plus à grands pas (avec des variants très différents) mais aurait trouvé dans le variant Omicron une « niche évolutive » à laquelle il reste attaché, préférant se perfectionner en « bricolant » des améliorations à la marge<ref name=fortune />.

Depuis le mois de septembre 2022, les scientifiques restaient très attentifs, car le variant BA.2.75 évoluait rapidement en tant que BA.2.75.2. Ce dernier était à cette date le variant le plus résistant aux anticorps disponibles. Sa capacité d'échapper à l'action neutralisante des anticorps serait cinq fois supérieure à celle du BA.5, le variant dominant du moment<ref name=ba2752 />.

=== Période de transition avec de nouveaux variants, plus contagieux ===
La situation à partir du mois d'octobre 2022 différait de celle des saisons précédentes. D'après Ryan Gregory, biologiste de l'[[université de Guelph]], une dizaine de variants Omicron entraient simultanément en compétition pour prendre la relève des variants BA.4 et BA.5. Il s'agissait notamment des BA.2.75, BA.2.75.2, BA.2.3.20, BA.4.6, BQ.1, BQ.1.1 et XBB. Le 12 octobre, l'[[Organisation mondiale de la santé]] aussi a publié sa liste de sous-variants sous surveillance : BA.5, BA.2.75, BJ.1, BA.4.6, XBB, BA.2.3.20<ref>Organisation mondiale de la santé, ''Suivi des variants du SARS-CoV2'', mise à jour les 4 et 12 octobre 2022 [https://www.who.int/fr/activities/tracking-SARS-CoV-2-variants] consulté le 3 décembre 2022</ref>. Ceux-ci ont tendance à échapper à l'immunité acquise par une infection ou un vaccin<ref>[https://ici.radio-canada.ca/nouvelle/1922953/pandemie-covid-variants-omicron-coronavirus-vague Avec un virus toujours en évolution, la Covid-19 n'a pas dit son dernier mot], [[Société Radio-Canada|Radio Canada]], le 9 octobre 2022</ref>.

Parmi eux, deux variants étaient particulièrement surveillés<ref name=FSnsv>{{Lien web|auteur=Julie Kern|url=https://www.futura-sciences.com/sante/actualites/coronavirus-xbb-bq11-sait-on-ces-nouveaux-sous-variants-omicron-101294/|titre=XBB et BQ.1.1 : que sait-on sur ces nouveaux sous-variants d'Omicron ? |site=[[Futura (portail web)|Futura-Sciences]]|en ligne le=14 octobre 2022}}.</ref>{{,}}<ref>{{Bibliographie|Q114670698}}.</ref>. D'une part, le variant BQ.1.1 {{—|alias B.1.1.529.5.3.1.1.1.1.1.1}}, qui aurait émergé au [[Nigeria]], semblait présenté comme pouvant être associé à des troubles digestifs tels que [[diarrhée]]s et [[vomissement]]s<ref>[https://www.20minutes.fr/sante/4005281-20221015-covid-19-nouveau-variant-b-q-1-1-responsable-troubles-digestifs-prudence ''Covid-19 : Le nouveau variant B.Q.1.1 est-il responsable de troubles digestifs ? Prudence''], 20 Minutes, le 15 octobre 2022.</ref>. Dans certains pays, ces sous-variants BQ.1 et BQ.1.1 connaissaient une augmentation rapide des cas diagnostiqués, par exemple en France 21 % (semaine 41)<ref>Le Journal des Femmes, ''Variant Covid BQ.1 : en hausse en France, c'est quoi ?'', le 28 octobre 2022 [https://sante.journaldesfemmes.fr/fiches-maladies/2857807-variant-covid-bq-1-1-nouveau-variant-covid-france/]</ref> ou 27 % aux États-Unis (29 octobre)<ref>The Conversation, ''Omicron BQ.1 and BQ.1.1'', le 31 octobre 2022 {{en}}[https://theconversation.com/omicron-bq-1-and-bq-1-1-an-expert-answers-three-key-questions-about-these-new-covid-variants-192873]</ref>. En France, son pic épidémique a été constaté en décembre 2022 (en tant que {{9e|vague}} de novembre-décembre 2022)<ref>{{Article |auteur1=Robin Serradeil |titre=INFOGRAPHIES. Covid-19 : contaminations, variant... la France a passé le pic épidémique de la 9e vague |périodique=[[La Dépêche du Midi|La Dépêche]] |date=17-12-2022 |lire en ligne=https://www.ladepeche.fr/2022/12/17/infographies-covid-19-contaminations-variant-la-france-a-passe-le-pic-epidemique-de-la-9e-vague-10874842.php |consulté le=09-04-2023}}.</ref>. D'autre part, le XBB est un variant issu d'une [[recombinaison virale]] de BA.2.10.1 et de BA.2.75. Il avait été identifié le {{Date-|12 septembre 2022}} à [[Singapour]]. La caractéristique de ce variant est qu'il existe plus de risque de réinfection, notamment pour ceux qui ont été contaminés par un variant de Covid avant que celui d'Omicron n'apparaisse. À la fin du mois d'octobre 2022, il représentait 1,3 % des contaminations dans le monde entier et se présentait dans 35 pays<ref>OMS, ''TAG-VE statement on Omicron sublineages BQ.1 and XBB'', le 27 octobre 2022 {{en}}[https://www.who.int/news/item/27-10-2022-tag-ve-statement-on-omicron-sublineages-bq.1-and-xbb] consulté en ligne le 23 novembre 2022</ref>.

En décembre, Tedros Adhanom Ghebreyesus, directeur général de l'[[Organisation mondiale de la santé|OMS]], a déclaré que circulent dans le monde entier plus de 500 sous-variants Omicron, tous plus contagieux<ref>Le Parisien, ''Covid-19 : 90% de la population mondiale présente une forme d'immunité, selon l'OMS'', le 2 décembre 2022 [https://www.leparisien.fr/societe/sante/covid-19-90-de-la-population-mondiale-presente-une-forme-dimmunite-selon-loms-02-12-2022-G7VOYRPA45FTDPNFXN5JXQ3YHI.php]</ref>. Auparavant, au contraire, un nouveau variant remplace toujours un Covid précédent.

Par ailleurs, la fin de l'année 2022 on observait une flambée épidémique du BF.7 (une sous-lignée du BA.5) en Chine, où l'immunité restait extrêmement basse, ce qui est constatée par le docteur Stuart Campbell Ray de l'[[université Johns-Hopkins]]. Dans ce pays, expliquait-il, sa nombreuse population et la vaccination vraiment moins efficace favorisaient cette explosion<ref>[[CBS]] News, ''China's COVID-19 surge raises odds of new coronavirus variants'', le 28 décembre 2022 {{en}}[https://www.cbsnews.com/news/china-covid-19-surge-new-coronavirus-variant-risk/]</ref>. Il est à noter que, dans la seconde moitié de 2022, ce variant BF.7 occupait jusqu'à quasiment 25% de contamination aux Pays-Bas, puis diminue devant l'évolution du BQ.1<ref name="2022_www.rivm.nl" />. Or, ce dernier, BQ.1, a quasiment disparu. En août 2023, on ne comptait que moins de 1% de contamination<ref name="santepublique082023" />.

=== XBB.1.5 dominant au premier semestre 2023 ===
En cette même fin d'année 2022, un autre sous-variant, de la lignée recombinante XBB (BJ.1 x BA.2.75), s'imposait aux [[États-Unis]] : le XBB.1.5 y a été détecté en octobre 2022<ref name=cepcm />. Il présentait pour l'Europe, un risque épidémique supérieur au sous-variant chinois du fait de l'immunisation acquise au sortir de la vague BA.5<ref>{{lien web |auteur1=franceinfo |titre=Covid-19 : ce que l'on sait de XBB.1.5, le nouveau variant d'Omicron qui se propage aux Etats-Unis |url=https://www.francetvinfo.fr/sante/maladie/coronavirus/covid-19-ce-que-l-on-sait-de-xbb-1-5-le-nouveau-variant-d-omicron-qui-se-propage-aux-etats-unis_5577804.html |site=[[France Info|francetvinfo.fr]] |date=03-01-2023 |consulté le=09-04-2023}}.</ref>{{,}}<ref>https://www.ouest-france.fr/sante/virus/coronavirus/covid-19-quatre-questions-sur-xbb-1-5-le-nouveau-variant-d-omicron-e199e984-8b6e-11ed-9caf-0ee455432178</ref>. Le 13 janvier 2023, le [[Centre européen de prévention et de contrôle des maladies]] a signalé que ce variant XBB.1.5 deviendrait dominant en Europe, même si la présence du XBB.1.5 y restait moins de 2,5% à la fin de l'année. Son calcul utilisant le modèle mathématique donnait sa prévision. Aux États-Unis le XBB.1.5 propageait 12% plus vite en janvier 2023<ref name="cepcm">[[Centre européen de prévention et de contrôle des maladies]], ''ECDC assesses risk to the EU / EEA associated with Omicron XBB.1.5 sub-lignage'', le 13 janvier 2023 {{en}}[https://www.ecdc.europa.eu/en/news-events/covid-19-implications-spread-omicron-xbb15]</ref>. En conséquence, les [[Centres pour le contrôle et la prévention des maladies]] (CDC) estimait qu'à la première semaine de février, le variant XBB.1.5 y présentait 74,7% de contamination avec sa domination, mais sans provoquer trop d'hospitalisation<ref name=lax>{{article|langue=en|périodique=Los Angeles Times|titre=California tops 12 million corona virus cases as XBB.1.5 becomes dominant|année=2023|mois=2|jour=13|auteur1=Luke Money|lire en ligne=https://www.latimes.com/california/story/2023-02-13/california-tops-12-million-covid-cases-xbb15-now-dominant}}</ref>. Le 23 mars, la Santé publique France déclare qu'à la semaine 9 (du 27 février au 5 mars), le XBB.1.5 représentait 56% de contamination contre 45% à la semaine 8<ref>{{article|langue=fr|année=2023|mois=3|jour=23|périodique=Santé publique France|titre=Point épidémiologique COVID-19 du 22 mars|lire en ligne=https://www.santepubliquefrance.fr/presse/2023/point-epidemiologique-covid-19-du-22-mars-2023-poursuite-de-l-augmentation-des-indicateurs-virologiques-a-des-niveaux-faibles}}</ref>.

Après avoir détecté en janvier 2023 un nouveau variant XBB.1.16 (ou Arcturus), l'Inde connaissait son explosion inattendue à partir de mois de mars<ref name=dailymail4 />. Aux États-Unis et en Angleterre, ce variant a commencé à remplacer le XBB.1.5<ref>{{article|langue=en|titre=Coronavirus variant XBB.1.16 spotted in 18 US States|auteur1=Ashleigh Hollowell|année=2023|mois=4|jour=3|périodique=Becker Hospital Review|lire en ligne=https://www.beckershospitalreview.com/public-health/coronavirus-variant-xbb-1-16-spotted-in-18-u-s-states.html}}</ref>. Il s'agit d'un recombinant de BA.2.10.1 et de BA.2.75, renforcé de trois mutations supplémentaires, E180V, F486P et K478R.

En ce qui concerne le nombre des variants d'Omicron qui circulaient dans le monde entier, l'OMS a révisé et augmenté en avril son estimation de 500 à plus de 600<ref name=dailymail4>{{article|langue=en|périodique=Daily Mail|année=2023|mois=4|jour=13|titre=How do you know if you've got Arcturus ? Everything you need to know about new Covid strain causing chaos in India|lire en ligne=https://www.dailymail.co.uk/health/article-11968535/Everything-need-know-new-Covid-variant-Arcturus-causing-carnage-India.html}}</ref>.

En juin 2023, le Covid-19 a considérablement diminué en France, selon la Santé publique France : 332 nouveaux cas entre 6 et 12 juin ainsi que taux de reproduction de la semaine du 28 mai 0,9. Nonobstant, le virus circulait toujours, et parmi les virus séquencés, 99,8% d'Omicron ont été détectés (semaine du 22 mai). Le recombinant XBB.1.5 restait majoritaire mais avec 45% de séquences<ref>Santé publique France, ''Coronavirus (COVID-19)'', consulté en ligne le 12 juin 2023</ref>. Enfin, ce dernier a diminué très rapidement. Devant les EG.5 et XBB.1.6, celui-ci ne se présentait, le 31 août, que 11% en France<ref name=santepublique082023 />.

=== Variant EG.5.1, dit Eris ===
Le 19 juillet 2023, l'OMS a ajouté un nouveau variant dans la liste de l'investigation, juste avant que celui-ci ne rebondisse dans plusieurs pays. Il s'agit de la souche EG.5.1 qui est une descendance de XBB.1.9.2<ref>OMS, ''Tracking SARS-CoV-2 variants'' daté du 9 août 2023 {{en}}{{lire en ligne|lien=https://www.who.int/activities/tracking-SARS-CoV-2-variants}} consulté en ligne le 11 août 2023</ref>. Cette souche avait été détectée en mars 2023<ref>En ce qui concerne le variant EG.5, le 17 février.</ref>. Le variant a été surnommé Eris par Ryan Gregory, d'après [[Éris]]. Au Royaume-Uni, ce variant était responsable de 14,55 % de contamination, le 20 juillet. Le Covid EG.5.1 a fait augmenter l'hospitalisation dans ce pays, notamment parmi les personnes âgées. Aux États-Unis aussi, c'était le variant le plus propagé, avec 17,3 % de nouveaux cas enregistrés le 5 août, qui causait l'hospitalisation. Au début du mois d'août, celui-ci se présente dans 36 pays, surtout en Asie<ref>{{article|langue=fr|année=2023|mois=8|jour=7|périodique=Midi Libre|titre=Eris, le nouveau variant du Covid|auteur1=Elise Do Marcolino|lire en ligne=https://www.midilibre.fr/2023/08/07/eris-le-nouveau-variant-du-covid-contagiosite-nombre-de-cas-quel-est-ce-virus-qui-descend-domicron-11383307.php}}</ref>{{,}}<ref>{{article|langue=fr|année=2023|mois=8|jour=6|périodique=i24NEWS|titre=Covid-19 : Une Nouvelle Variante gagne du terrain dans 36 pays|lire en ligne=https://www.i24news.tv/fr/actu/coronavirus/1691336284-covid-19-une-nouvelle-variante-gagne-du-terrain-dans-36-pays}}</ref>{{,}}<ref>{{article|langue=en|auteur1=Lisa O'Mary|année=2023|mois=8|jour=7|périodique=WebMD News Brief|titre=U.S. Has New Dominant COVID Variant called EG.5|lire en ligne=https://www.webmd.com/covid/news/20230807/us-has-new-dominant-covid-variant-called-eg5}}</ref>. La même tendance était constatée en France. Selon [[GISAID]], ce variant y a gagné 35 % des analyses. (Or, l'épidémiologiste [[Antoine Flahault]] soulignait sur ce variant Eris qu'en été 2023, les autorités européennes ne disposaient d'aucune donnée fiable.) Ce qui reste certain était qu'en plein mois d'août, les variants Omicron circulaient sur l'[[hémisphère nord]], à la différence des étés précédents, par exemple à [[Bayonne]], où les [[fêtes de Bayonne]] ont contribué à propager le Covid<ref>{{article|langue=fr|année=2023|mois=8|jour=8|périodique=Actu.fr|titre=Covid-19 : ce que l'on sait du variant Eris, à l'origine d'un regain des contaminations en France|lire en ligne=https://actu.fr/societe/covid-19-ce-que-l-on-sait-du-variant-eris-a-l-origine-d-un-regain-des-contaminations-en-france_59942567.html}}</ref>. 

À partir du 17 août, l'OMS plaçait un autre variant BA.2.86, dit désormais Pirola, dans la liste de surveillance. Si celui-ci y a été ajouté, c'était parce que ce variant possède un nombre important de mutations (plus de 30) en comparaison de l'origine BA.2. Le premier cas en France a été révélé par la Santé publique le 31 août, selon laquelle il s'agissait d'un prélèvement hebdomadaire du 21 août. Le 31 août, 25 autres séquences étaient enregistrés dans le monde entier, dont 10 cas en [[Danemark]]. Par ailleurs, à ce jour-là, la tendance du Covid en France restait EG.5, dont le sous-lignage EG.5.1 était majoritaire, avec 34% de contamination<ref name=santepublique082023>{{article|langue=fr|périodique=Santé publique France|année=2023|mois=9|jour=1|titre=COVID-19 : un premier cas de variant BA.2.86 détecté en France|lire en ligne=https://www.santepubliquefrance.fr/les-actualites/2023/covid-19-un-premier-cas-de-variant-ba.2.86-detecte-en-france}} (voir aussi la rubrique ''Pour en savoir plus : Analyse de risque liée aux variants émergents de SARS-CoV-2 (31/08/2023)'' dans cet article)</ref>. À la fin de l'année 2023, le EG.5 était, assez rapidement, remplacé par le nouveau variant JN.1 (entre les 2 et 8 janvier 2024, le EG.5 ne restait que 3%) tandis que la propagation du BA.2.86 restait faible en France<ref name=spf31012024>Santé publique France, ''Bulletin du 31 janvier 2024'', p. 16</ref>.

=== Propagation très rapide du nouveau variant JN.1 ===
Le variant BA.2.86 a donné naissance à son sous-variant JN.1 (ou BA.2.86.1.1), qui est devenu important. En novembre, ce dernier a été détecté dans plusieurs pays de l'Europe, y compris en France, ainsi qu'aux États-Unis. Tout comme d'autres variants d'Omicron, il n'y aurait pas de symptômes plus graves, mais il est plus transmissible<ref>{{article|langue=fr|année=2023|mois=11|jour=13|auteur1=Johann Foucault|périodique=Actu fr|titre=Covid-19. Viralité, symptômes... Ce que l'on sait de JN.1, un nouveau variant détecté en France|lire en ligne=https://actu.fr/societe/coronavirus/covid-19-viralite-symptomes-ce-que-l-on-sait-de-jn-1-un-nouveau-variant-detecte-en-france_60328895.html}}</ref>. Le 19 décembre, l'OMS a déclaré le JN.1 comme une variante d'intérêt, dorénavant distinguée du BA.2.86. En effet, l'organisation avait constaté sa plus rapide propagation en comparaison d'autres souches, y compris son parent. Dans la semaine 44, ce variant ne présentait que 3,3% de séquences dans le monde entier. Or, entre le 27 novembre et le 3 décembre (semaine 48), on compte 27,1% de ses séquences et son existence dans 41 pays. La France est l'un des pays où le JN.1 augmente très rapidement<ref>OMS, ''Compte-rendu'' du 19 décembre 2023 {{en}}{{lire en ligne|lien=https://www.who.int/docs/default-source/coronaviruse/18122023_jn.1_ire_clean.pdf?sfvrsn=6103754a_3}} (consulté le 20 décembre 2023)</ref>. Selon le bulletin de la santé publique France publié le 27 décembre 2023, le variant JN.1 y représentait 64% de séquences le 4 décembre (contre 52% pour celles du 27 novembre)<ref>Santé publique France, ''Bulletin du 27 décembre 2023'', {{lire en ligne|lien=https://www.santepubliquefrance.fr/maladies-et-traumatismes/maladies-et-infections-respiratoires/grippe/documents/bulletin-national/infections-respiratoires-aigues-grippe-bronchiolite-covid-19-.-bulletin-du-27-decembre-2023}} (pdf) (consulté le 2 janvier 2024)</ref> et a atteint 92 % le 19 février 2024<ref name=spf27032024>Santé publique France, ''Bulletin du 27 mars 2024'', p. 16 (consulté le 27 mars 2024)</ref>. C'est pour la première fois qu'en France hexagonale, un variant est arrivé à un tel niveau après la première vague d'Omicron par le B.1.1.529<ref>Santé publique France, ''Bulletin du 17 janvier 2024'', p. 17 (consulté le 17 janvier 2024)</ref>. Aux États-Unis aussi, le 5 janvier 2024 les [[Centres pour le contrôle et la prévention des maladies]] (CDC) ont déclaré qu'à partir du 24 décembre, les cas du JN.1 ont rebondi jusqu'à 61,6% de contamination alors qu'au début de novembre, pendant 2 semaines, le JN.1 ne représentait que 3%. L'analyse des eaux usées, qui est actuellement la meilleure façon de détecter le Covid, confirme cette tendance<ref>{{article|langue=en|année=2024|mois=1|jour=5|périodique=Fast Company|titre=JN.1 COVID variant is exploding across the U.S., according to new CDC data|auteur1=Chris Morris|lire en ligne=https://www.fastcompany.com/91005970/jn1-covid-variant-spread-symptoms-cdc-data}}</ref>. 

Ces CDC a mis, le 31 janvier 2024, un nouveau variant BA.2.87.1 dans la liste de surveillance. Malgré plus de 100 mutations dont 32 environ sur la protéine Spike et 7 [[délétion]]s<ref>Centers for Disease Control and Prevention, ''CDC Tracks New SARS-CoV-2 Variant, BA.2.87.1'', le 9 février 2024 {{en}}{{lire en ligne|lien=https://www.cdc.gov/respiratory-viruses/whats-new/covid-19-variant-update-2024-02-09.html}} (consulté le 24 frévrier 2024)</ref>{{,}}<ref>{{article|langue=fr|année=2024|mois=2|jour=4|périodique=Nouvelles du monde|titre=Covid, la nouvelle variante BA.2.87.1 arrive d'Afrique du Sud|consulté le=27 février 2024}}</ref>, celui-ci n'a pas provoqué une conséquence importante. Et en mai, c'est un autre variant KP.2 (ou surnommé FLiRT) qui attire l'attention des chercheurs. Très proche du JN.1, il gagne 28% de contamination aux États-Unis au début de mai, avec le JN.1 qui reste dominant<ref>{{article|langue=en|année=2024|mois=5|jour=13|auteur1=Aliza Rosen|périodique=John Hopkins University|titre=What to Know About COVID FLiRT Variants|consulté le=25 mai 2024|lire en ligne=https://publichealth.jhu.edu/2024/what-to-know-about-covid-flirt-variants}}</ref>.

=== Recombinaison avec variant Delta sans bilan comptable ===
Détecté au Royaume-Uni, à [[Leicestershire]] où les habitants indiens sont nombreux, un nouveau variant CH.1.1, dit Orthrus, était en surveillance. Cette souche y fut détectée, pour la première fois, en novembre 2022 tandis qu'elle se trouvait également en Inde et en Espagne. En surveillance, car, d'une part, en Angleterre, ce variant évoluait très vite dans la population. D'autre part, il s'agit d'un variant issu de BA.2.75<ref>{{Article|langue=fr|auteur1=Marc Gozlan|périodique=Le Monde|lire en ligne=https://www.lemonde.fr/blog/realitesbiomedicales/2022/11/28/covid-19-comment-omicron-a-t-il-evolue-depuis-son-emergence-il-y-a-un-an/|année=2022|mois=11|jour=28|titre=Covid-19 : comment Omicron a-t-il évolué depuis son émergence il y a un an ?}}</ref> mais qui partage la mutation P681R avec le variant Delta, lequel provoque un symptôme plus grave. P681R est une mutation très connue. Elle est si agressive que le Delta peut attaquer plus facilement les cellules humaines. Selon les autorités britanniques, le CH.1.1 y présentait en janvier 2023 plus de 20% de contamination<ref>{{Article|titre=Covid-19 : tout savoir sur le nouveau sous-variant d'Omicron, le CH.1.1, a surgi en Angleterre.|auteur1=Sebastien Bozon|jour=21|mois=1|année=2023|périodique=CNews|langue=fr|lire en ligne=https://www.cnews.fr/sante/2023-01-21/covid-19-tout-savoir-orthrus-le-nouveau-sous-variant-domicron-qui-inquiete}}</ref>{{,}}<ref name=ussun>{{Article|langue=en|périodique=The U. S. Sun|titre=New threat as time-lapse maps reveal how new Covid variant Orthrus has spread through UK|auteur1=Terri-Ann Williams|jour=17|mois=1|année=2023|lire en ligne=https://www.the-sun.com/health/7155466/new-threat-time-lapse-maps-new-covid-orthrus/}}</ref>.

À la suite de l'étude de l'[[université d'État de l'Ohio]], l'évolution du variant CA.3.1 aussi était suivie par les chercheurs. Apparue aux États-Unis en décembre 2022, cette souche aussi possède la mutation L452R du variant Delta. Les scientifiques restent très attentifs, car la recombinaison peut provoquer tant plus de transmissibilité que le symptôme plus grave<ref>{{Article|langue=en|auteur1=Administratif de site|titre=COVID-19 : XBB.1.5 - CH.1.1 - CA.3.1 Variants Have Increased Fusogenicity Than BA.2|périodique=Debug Lies News|jour=18|mois=1|année=2023|lire en ligne=https://debuglies.com/2023/01/18/covid-19-xbb-1-5-ch-1-1-ca-3-1-variants-have-increased-fusogenicity-than-ba-2/}}</ref>. L'étude de l'Ohio révèle aussi que ces CH.1.1 et CA.3.1 sont capables de résister plus fortement à la neutralisation du corps humain effectuée par l'anticorps. Leur capacité est supérieure à celle des variants XBB<ref>{{Article|langue=en|auteur1=Tim Svebdson|périodique=Local Today California News|titre=SARS-CoV-2 Omicron XBB.1.5, CA.3.1 and CH.1.1 show remarkable antibody resistance|jour=23|mois=1|année=2023|lire en ligne=https://localtoday.news/ca/sars-cov-2-omicron-xbb-1-5-ca-3-1-and-ch-1-1-show-remarkable-antibody-resistance-218394.html}}</ref>.

Toutefois, en juin 2023, ces variants ne se présentait guère en France, devant la domination des variants Omicron sur d'autres souches.

=== Usage des noms de monstres dans la légende ===
Omicron, caractérisé de sa capacité de recombinaison, compte un grand nombre de variants. Inspiré par la [[mythologie grecque]], on met en usage des noms de monstres grecs (et d'autres monstres célèbres), car, dans cette mythologie, les couples de monstre donnaient naissance à d'autres monstres, tout comme l'apparence de virus Omicron. D'abord, l'usage fut établie pour [[Orthos]] (CH.1.1) et [[Kraken]] (XBB.1.5)<ref name=ussun />.

C'est Ryan Gregory (mentionné au-dessus, [[université de Guelph]]) qui créa une liste de variants<ref>{{article|langue=fr|périodique=Le Monde|auteur1=Marc Gozlan|année=2023|mois=1|jour=11|titre=COVID-19 : dans le maquis des variants et sous-variants d'Omicron|lire en ligne=https://www.lemonde.fr/blog/realitesbiomedicales/2023/01/11/covid-19-dans-le-maquis-des-variants-et-sous-variants-domicron/}}</ref>. En effet, d'une part, l'OMS cessa à attribuer le lettre grec à une nouvelle souche, après le variant Omicron. D'autre part, selon lui, le public peut être trompé, avec la dénomination d'après le lignage, qui devint de plus en plus compliquée. C'est pourquoi il avait proposé sa liste, en considérant qu'elle est indispensable<ref name=ryan>{{article|langue=en|auteur1=Erin Prater|jour=5|mois=1|année=2023|titre=Meet the biology professor who named the surging Kraken COVID variant. He has more to help make sense of Omicron 's alphabet soup.|périodique=Fortune Well|lire en ligne=https://fortune.com/well/2023/01/05/kraken-variant-omicron-covid-name-ryan-gregory-biology-professor/?showAdminBar=true}}</ref> :<br />

BA.2.3.20 ([[basilic (mythologie)|Basilisk]]) ; BA.2.75 ([[centauros|Centaurus]]) ; BA.2.75.2 ([[Chiron (mythologie)|Chiron]]) ; BA.2.75.6 (Dictys) ; BA.2.86 (Pirola) ; BA.4.1.9 ([[Céto|Cetus]]) ; BA.4.6 (Aeterna) ; BA.5.1 ([[Sphinx]]) ; BA.5.2 ([[Triton (mythologie)|Triton]]) ; BF.7 ([[Minotaure]]) ; BF.11 ([[Python (mythologie)|Python]]) ; BJ.1 ([[Argos (Panoptès)|Argus]]) ; BM.1.1.1 (Mimas) ; BN.1 (Hydra) ; BQ.1 ([[Typhon (mythologie)|Typhon]]) ; BQ.1.1 ([[Cerbère|Cerberus]]) ; EG.5.1 ([[Éris]]) ; XBB ([[Griffon (mythologie)|Gryphon]]) ; XBB.1 ([[Hippogriffe|Hippogryph]]) ; XBB.1.16 (Arcturus).

En ce qui concerne le nouveau variant JN.1 ou BA.2.86.1.1, Ryan Gregory ne le qualifie que comme « clan Pirola ». Cependant, quelques journalistes ont commencé, malgré lui, à utiliser le nom de « Juno », qui n'a pas d'origine grecque.    

Rien n'est officiel, or des journalistes emploient ces noms, mais avec la dénomination de lignage<ref name=fortune022023>{{article|langue=en|auteur1=Erin Prater|année=2023|mois=2|jour=9|périodique=Fortune Well|titre=The World needs to calm down about the risk of a new COVID variant emerging from China, the country's former CDC chief says|lire en ligne=https://fortune.com/well/2023/02/09/world-should-calm-down-risk-new-dangerous-covid-variants-evolving-china-zero-covid-omicron-cdc-pandemic-xi/}}</ref>.

== Notes et références ==
{{Traduction/Référence|en|SARS-CoV-2 Omicron variant|1057331191|type=note}}
{{Références nombreuses|taille=28|références=

<ref name="who-statement">{{lien web|langue=en |date=26 novembre 2021 |titre=Classification of Omicron (B.1.1.529): SARS-CoV-2 Variant of Concern |url=https://www.who.int/news/item/26-11-2021-classification-of-omicron-(b.1.1.529)-sars-cov-2-variant-of-concern |consulté le=26 novembre 2021 |website=[[Organisation mondiale de la santé|{{lang|en|World Health Organization}}]] }}.</ref>

<ref name="26novembre2021_www.telegraph.co.uk">{{article|nom=Parekh |prénom=Marcus |nom2=Platt |prénom2=Poppie |nom3={{lang|en|Team}} |auteur institutionnel=Global Health Security Team |nom4=Barnes |prénom4=Joe |date=2021-11-26 |titre=Coronavirus latest news: EU suspends all flights to southern Africa over omicron Covid variant fears |langue=en-GB |périodique=[[The Daily Telegraph|{{lang|en|The Telegraph}}]] 
   | url=https://www.telegraph.co.uk/global-health/science-and-disease/covid-new-south-african-variant-strain-lockdown-restrictions/ 
   | consulté le=2021-11-26 |issn=0307-1235}}.</ref>

<ref name=":1">{{lien web|nom=Meyer |prénom=David |date=2021-11-16 |titre=What's Omicron? Here's what we know and don't know about the new COVID variant that's roiling markets and air travel |url=https://fortune.com/2021/11/26/nu-covid-variant-who-south-africa-markets-oil-crypto-air-travel/ |consulté le=2021-11-26 |website=[[Fortune (magazine)|{{lang|en|Fortune}}]] |langue=en}}.</ref>

<ref name="TheNewYorkTimes">{{article|nom=Patel |prénom=Vimal |date=2021-11-27 |titre=How Omicron, the New Covid-19 Variant, Got Its Name |langue=en-US |périodique={{lang|en|[[The New York Times]]}} |url=https://www.nytimes.com/2021/11/27/world/africa/omicron-covid-greek-alphabet.html |consulté le=2021-11-28 |issn=0362-4331 |archive-date=28 novembre 2021 |archive-url=https://web.archive.org/web/20211128015620/https://www.nytimes.com/2021/11/27/world/africa/omicron-covid-greek-alphabet.html}}.</ref>

<ref name="NewsNationNow">{{lien web|date=2021-11-27 |titre=There are several COVID-19 variants you haven't heard of |url=https://www.newsnationnow.com/health/coronavirus/there-are-several-covid-19-variants-you-havent-heard-of/ |consulté le=2021-11-27 |website=[[NewsNation|{{lang|en|NewsNation Now}}]] |langue=en-US |archive-date=27 novembre 2021 |archive-url=https://web.archive.org/web/20211127211302/https://www.newsnationnow.com/health/coronavirus/there-are-several-covid-19-variants-you-havent-heard-of/}}.</ref>

<ref name="TheEconomist">{{article|date=26 novembre 2021 |titre=Countries are scrambling to stop a new covid variant |langue=en-GB |périodique={{lang|en|[[The Economist]]}} |url=https://www.economist.com/science-and-technology/2021/11/26/a-new-covid-19-variant-has-emerged/ |consulté le=26 novembre 2021 |archive-date=26 novembre 2021 |archive-url=https://web.archive.org/web/20211126230507/https://www.economist.com/science-and-technology/2021/11/26/a-new-covid-19-variant-has-emerged}}.</ref>

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<ref name="2022_www.rivm.nl">National Institute for Public Health and the Environment (Pays-Bas), ''Variants of the coronavirs SARS-Cov-2'', le 23 décembre 2022 {{en}}[https://www.rivm.nl/en/coronavirus-covid-19/virus/variants]</ref>

<!-- Référence de WP:EN non utilisées :
<ref name="Falcon">{{article|lang=en |url=https://www.kxan.com/news/its-omicron-not-omnicron-covid-variants-spelling-doesnt-have-two-ns/ |nom=Falcon |prénom=Russell |titre=It’s ‘omicron,’ not ‘omnicron’: COVID variant’s spelling doesn’t have two Ns |périodique=[[KXAN]] |date=29 novembre 2021 | consulté le=1 décembre 2021}}.</ref>
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-->}}

== Voir aussi ==
=== Articles connexes ===
* [[Variants du SARS-CoV-2]]

=== Liens externes ===
{{Liens}}
* {{en}} [https://www.gisaid.org/hcov19-variants/ Données actualisées du GISAID sur la propagation du variant Omicron]
* {{lien web|lang=en |site={{lang|en|{{lien|lang=en|trad=UK Health Security Agency}}}} |url=https://assets.publishing.service.gov.uk/government/uploads/system/uploads/attachment_data/file/1038442/3_December-2021-risk-assessment-for-SARS_Omicron_VOC-21NOV-01_B.1.1.529.pdf |titre=3 December 2021 Risk assessment for SARS-CoV-2 variant: Omicron (B.1.1.529) |format=pdf}}

{{Palette|SARS-CoV-2|Pandémie de Covid-19}}
{{Portail|maladie à coronavirus 2019}}

[[Catégorie:Variant du SARS-CoV-2|Omicron]]
[[Catégorie:Pandémie de Covid-19 en Afrique]]