Génome
Le génome est l'ensemble du matériel génétique d'un individu ou d'une espèce. Les gènes ne constituent qu'une partie du génome. Celui-ci est constitué de molécules d'acides nucléiques : l'ADN et l'ARN.
- Chez les virus, le génome est contenu soit dans une molécule d'ADN simple ou double brin, soit dans une molécule d'ARN.
- Chez les procaryotes (exemple : bactéries), on distingue le génome chromosomique, contenu dans une molécule d'ADN circulaire, et le génome extrachromosomique, contenu dans des plasmides et des épisomes.
- Chez les eucaryotes, on distingue trois types de génomes :
- le génome nucléaire (dans le noyau)
- le génome mitochondrial (dans les mitochondries), transmis par la mère (1).
- le génome chloroplastique (dans les chloroplastes), chez les plantes.
La science qui étudie le génome est la génomique.
(1) Lors de la reproduction, le corps du futur œuf provient de la mère et contient les mitochondries et la moitié du futur génome nucléaire. Les gamètes mâles fournissent l'autre moitié du génome nucléaire.
Taille du génome
La taille du génome se mesure en nombre de nucléotides, ou bases. La plupart du temps, on parle de pb (pour paire de base, puisque la majorité des génomes est constituée de doubles brins d'ADN ou d'ARN). On emploie souvent les multiples kpb (pour kilo-base) ou Mpb (méga-base), qui valent respectivement 1 000 et 1 000 000 bases. La taille du génome peut être exprimée en pg (pico-grammes), ce qui correspond à la masse d'ADN (haploïde) par cellule. 1 pg représente environ 1 000 Mpb (978 Mpb précisément).
La taille du génome peut varier de quelques kilobases chez les virus à plusieurs centaines de milliers de Mb chez certains eucaryotes. La quantité d'ADN, contrairement à ce qui a été longtemps supposé, n'est pas proportionnelle à la complexité d'un organisme ; ainsi, l'amibe Amoeba dubia, un organisme unicellulaire, a un génome environ 200 fois plus grand que Homo sapiens. Ce constat est fréquemment appelé paradoxe de la valeur C.
| Organisme | Taille du génome (Mpb)) | |
|---|---|---|
| Virus | Bacteriophage λ | 0,05 |
| Procaryotes | Escherichia coli | 3,6 |
| Eucaryotes | Saccharomyces cerevisiae (Levure) | 12 |
| Caenorhabditis elegans | 97 | |
| Drosophila melanogaster | 180 | |
| Homo sapiens (homme) | 3 400 | |
| Arabidopsis thaliana | 100 000 | |
| Zea mais (maïs) | 500 000 | |
| Amoeba dubia | 1 400 000 |
Sources
http://www.infobiogen.fr/services/deambulum/fr/bioinfo_glos.htm